ISSN 1991-3087

Свидетельство о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-24978 от 05.07.2006 г.

ISSN 1991-3087

Подписной индекс №42457

Периодичность - 1 раз в месяц.

Вид обложки

Адрес редакции: 305008, г.Курск, Бурцевский проезд, д.7.

Тел.: 8-910-740-44-28

E-mail: jurnal@jurnal.org

Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100
Яндекс.Метрика

Аналогия биосистем и информационных систем: аспекты безопасности.

 

Суханов Андрей Вячеславович,

кандидат технических наук,

начальник управления специальных работ ЗАО «ЭВРИКА», г. Санкт-Петербург.

 

Наблюдается тенденция использования в создаваемых человеком сложных информационных системах элементов организации живой природы. Проведенный анализ показал, что основным принципом построения интеллектуальных средств защиты информации является принцип подобия биологических и информационных систем.

Биологические организмы обладают иерархической системой жизнеобеспечения и встроенными механизмами иммунитета, информационной избыточности и защиты. Параметры современных средств мониторинга безопасности значительно уступают биологическим аналогам, поэтому актуален анализ организации биосистем и разработка концепции построения сложных информационных систем, основанной на биосистемной аналогии.

В научных публикациях активно используются принципы и методы, свойственные биосистемам, к решению организационных и управленческих задач сложных технических, как правило, кибернетических систем [1, 2]. Целесообразно рассмотреть механизмы защиты биологических и информационных систем с точки зрения аналогии архитектурных особенностей и специфики протекания основных процессов: зарождения, наследования, адаптации и развития (рис. 1) [1]. В биосистемах названные процессы обуславливают основные процессы жизнедеятельности организма.

 

Рис. 1.

Биосистемная аналогия информационных систем.

 

Основные свойства биосистем.

 

Органическая жизнь в биосистеме поддерживается за счет осуществления в клетках взаимодействия нуклеиновых кислот и белков. Непрерывность жизни обеспечивается путем самовоспроизведения - высоконадежной передачей в поколениях генетической информации. Основой жизни являются соединения нуклеопротеидов – взаимосвязанный комплекс белков и нуклеиновых кислот [3]. Основные свойства жизни перечислены ниже [1].

·                    Самовоспроизведение основано на матричном синтезе дезоксирибонуклеиновых кислот (ДНК), который программирует синтез белков, определяющих специфику организма.

·                    Иерархическая организация: структурными и функциональными элементами являются клетки, которые организованы в ткани, ткани - в органы, а органы – в системы органов; организмы собраны в популяции, популяции – в биоценозы, биоценозы – в экосистемы, образующие биосферу.

·                    Упорядоченность структуры.

·                    Непрерывность и дискретность жизни на всех уровнях иерархии, как по структуре, так и по функции: клетка целостна, но состоит из дискретных специализированных клеточных структур, организм - целостная система из дискретных клеток, тканей, органов, систем органов; органический мир целостен, поскольку существование одних биологических организмов зависит от других, и дискретен, складываясь из отдельных организмов.

·                    Рост и развитие. Рост организма (количественные изменения) происходит за счет увеличения размеров и числа клеток, развитие (качественные изменения) – за счет усложнения структуры и функций организма.

·                    Обмен веществ и энергии в клетках ведет к восстановлению разрушенных структур, росту и развитию организма. Организм - открытая система, через которую проходят потоки веществ и энергии.

·                    Наследственность и изменчивость (факторы эволюции) гарантируют:

1) непрерывность жизни путем передачи потомству генетической информации (свойство стабильности);

2) появление признаков, отличных от исходных, в результате изменений в ДНК (свойство пластичности).

·                    Раздражимость необходима для взаимодействия с внешней средой.

·                    Движение связано с процессом адаптации организма во внешней среде.

·                    Внутренняя регуляция позволяет восстанавливать повреждения молекул ДНК, вызванные действием дестабилизирующих факторов и гарантирует стабильность генетического материала.

·                    Специфичность взаимоотношений со средой выражается в единстве - организмы зависят от среды, которую изменяют в процессе деятельности.

Иерархия биосферы разделена на уровни системной организации: нуклеотидный, триплетный, генный (вместе - молекулярный уровень), хромосомный, клеточный уровень, тканевый уровень, органный уровень, организменный уровень, популяционный уровень, видовой уровень, биоценотический уровень, глобальный (биосферный уровень).

На клеточном уровне осуществляются процессы, связанные с кодированием и передачей наследственной информации, обменом веществ и энергией, изменчивостью и генетической преемственностью, устойчивостью молекулярных структур. Обладая способностью к размножению, жизни и росту, клетки являются основой организации материи. Молекулярному уровню присуща генетическая преемственность и структурная устойчивость.

 

Биосфера как сложная информационная система.

 

Многообразие форм жизни можно представить совокупностью специализированных подсистем, различающихся архитектурой и свойствами, а биосферу – в виде сложной информационной системы, построенной по иерархическому принципу из взаимосвязанных подсистем. Иерархический принцип организации - один из подходов обеспечения жизнеспособности видов и повышения защищенности процессов хранения и передачи информации.

Архитектурная аналогия прослеживается при сопоставлении иерархии информационных систем (ИС) с соответствующей иерархией биосистем (табл. 1) [4].

 

Таблица 1

Уровень
биосистемы

Функция

Информационная система

Нейросетевая

система

1. Ядро

 

Хранение, изменение кодирование и декоди-рование, передача, информации.

Специализированные элементы и узловые схе-мы.

Компоненты формальных нейронов (ФН); ROM для хранения параметров ФН.

2. Клетка

Деление, рост, матрич-ный синтез.

Специализированные процессоры.

Уровень ФН.

3. Ткань

Среда межклеточных коммуникаций.

Мультипроцессор; сек-ции среды вычислений.

Фрагмент слоя из ФН; слой ФН.

4. Орган

Функциональная специализация

Функциональное устройство

Фрагмент нейронной сети (НС); НС

5. Организм

Законченная локализо-ванная система.

Среда вычислений, пер-сональный компьютер.

Специализированная НС; вычислительная машина – ВМ

6. Популяция

Воспроизводство видовой информации.

Гомогенная локальная сеть ВМ.

Универсальная нейросетевая вычислительная среда.

7. Вид

Межвидовое разграни-чение.

Гетерогенная локальная сеть ВМ.

Локальная НС корпоративного уровня.

8. Биоценоз

Локальное сосущество-вание видов.

Отраслевая сеть

Отраслевая сеть.

9. Биогеоценоз

Среда для локального сосуществования.

Домен глобальной сети.

Домен глобальной сети.

10. Биосфера

Глобальная взаимосвязь

Глобальная сеть.

Глобальная сеть.

 

Биосфера – иерархическая система с единым подходом к способам и методам преобразования, хранения и переноса информации, которые обладают высокой защищенностью. Обеспечение высокого уровня защищенности видов обусловлено функциональной устойчивостью способа кодирования, хранения и передачи информации - генетического кода. Замечена аналогия между свойствами, характерными для биосферы как биологической системы и как сложной ИС (табл. 2). Откуда следует, что биосфера - сложная информационная система, подсистемы которой обладают набором механизмов и свойств, придающим им высокую защищенность и надежность.

 

Таблица 2

Биологическая система

Система ИТ

Упорядоченность системы

Наличие иерархической организации.

Самовоспроизведение

Процесс сохранения и передачи информации в системе.

Специфичность организации

Отличие между системами различных уровней иерархии.

Целостность и дискретность

Целостность и дискретность.

Рост и развитие

Способность систем к наращиванию, самообучению и развитию

Обмен веществ и энергии

Открытость системы.

Наследственность и изменчивость

Перенос информации и большой потенциал изменения как кода, так и передаваемых сообщений.

Раздражимость

Наличие механизмов, обуславливающих поведение системы в зависимости от внешних воздействий.

Движение

Способность систем к адаптации.

Внутренняя регуляция

Наличие кибернетических механизмов и информационных потоков для внутреннего регулирования системы.

Специфичность взаимодействия со средой

Специфичность реагирования на внешние воздействия каждой подсистемой.

 

Придание ИС положительных качеств биосистем и, прежде всего, отвечающих за безопасность информационных процессов и ресурсов, м.б. обеспечено за счет: иерархии функционально разнородных подсистем с развитыми функциями защиты, сохранения и передачи информации; свойств сложной кибернетической системы; способности к росту и развитию, обучению и адаптации в динамичной среде; свойств стабильности и пластичности.

 

Защита информации в биосистемах.

 

Жизнеспособность биосистемы обеспечивается информационными механизмами наследственности и изменчивости. В качестве защищенного носителя информации выступает ДНК. Популяции существуют за счет процесса размножения, который сводится к передаче внутри вида генетической информации, кодируемой, декодируемой и хранимой ДНК (рис. 2) [5].

 

Рис. 2.

Схема двойной спирали молекулы ДНК:

А — аденин; Т — тимин; Г — гуанин; Ц — цитозин; Д — дезоксирибоза; Ф — фосфат.

 

Универсальность и защищенность молекулы ДНК обеспечивается единством свойств устойчивости и изменчивости - необходимых и достаточных условий эволюции. Специфика ДНК - в его двойственности: с одной стороны, как носителя информации, с другой - самой информации.

Молекулы ДНК – это линейные макромолекулы в виде длинных двойных цепей полимеров, составленных из нуклеотидов. У живых существ макромолекулы ДНК слагаются из одних и тех же нуклеотидов, каждый из которых содержит по одной молекуле фосфорной кислоты и сахара, а также одно из четырех азотистых оснований: аденин - A, гуанин - G, цитозин - C и тимин - T. Аденин и гуанин – пуриновые основания, цитозин и тимин – пиримидиновые [3, 5].

Согласно [5], дезоксирибонуклеиновая кислота, высокополимерное соединение, содержащееся в ядрах клеток живых организмов. ДНК — носитель генетической информации, её отдельные участки соответствуют определенным генам. Молекула ДНК состоит из 2 цепей, закрученных в спираль. Цепи построены из мономеров 4 типов, специфичность которых определяется одним из 4 азотистых оснований (нуклеотидов): A, G, C, T. Сочетания в цепи ДНК трёх рядом стоящих нуклеотидов (триплеты, или кодоны) составляют код генетический. Нарушения последовательности нуклеотидов в цепи ДНК приводят к наследственным изменениям — мутациям. ДНК воспроизводится при делении клеток, что обеспечивает в ряду поколений передачу наследственных признаков.

В ДНК различают первичную, вторичную и третичную структуру. Первичная структура ДНК - последовательность нуклеотидов в полинуклеотидных цепях, вторичная структура ДНК - две скрученных слева направо спирали с периодом, равным десяти азотистым основаниям; спирали инверсны (комплементарны) одна относительно другой. Третичная структура ДНК связана с трехмерной пространственной конфигурацией молекул.

Исследования ДНК выявили ряд закономерностей (правила Чаргаффа):

·                    число нуклеотидов, содержащих пуриновые основания равно числу нуклеотидов, содержащих пиримидиновые основания (A+G=T+C);

·                    в ДНК содержание аденина и тинина равны; содержание гуанина и цитозина равны (A=T или G=C), т. е.  (G+T)/(A+C) = 1;         

·                    ДНК могут иметь различия, обусловленные преобладанием аденина над гуанином и тимина над цитозином (А+Т>C+G), и наоборот (C+G >А+Т);

·                    отношение (C+G)/(А+Т) видоспецифично: ДНК идентичны во всех клетках одного организма и отношение (C+G)/(А+Т) одинаково.

Разнообразие органической жизни построено из 20 видов аминокислот (табл. 3).

Кодирование аминокислот триплетами вырожденное и приводит к избыточности, т. к. число комбинаций 43 = 64, втрое превышает разнообразие аминокислот - каждой аминокислоте соответствует ряд триплетов.

Правило вырожденности: если два кодона имеют два одинаковых первых нуклеотида и их третьи нуклеотиды принадлежат к одному классу (пуриновому или пиримидиновому), то они кодируют одну аминокислоту.

В ДНК цепи полимеров соединены между собой водородными связями, в соответствии с правилом комплементарности: каждый кодон имеет только один антикодон, способный связаться с ним по всем водородным связям.

Надежность и устойчивость структуры ДНК обуславливается надежностью и силой водородных связей: аденин и тимин образуют две водородные связи А=Т, а гуанин и цитозин – три CºG (связь А=Т слабее связи CºG).

 

Таблица 3



Аминокислота

Кодон

Мольная масса Мк

Антикодон

Мольная масса Ма

S (Мк + Ма)

 

ПРО

CCC

330

GGG

450

780

CCT

345

GGA

434

779

CCA

354

GGT

429

779

CCG

370

GGC

410

780

 

 

ЛЕЙ

CTC

345

GAG

434

779

CTT

360

GAA

418

778

CTA

369

GAT

409

778

CTG

385

GAC

394

779

TTA

384

AAT

393

777

TTG

400

AAC

378

778

ГИС

CAC

354

GTG

425

779

CAT

369

GTA

409

778

ГЛУ-NH2

CAA

378

GTT

400

778

CAG

394

GTC

385

779

 

 

АРГ

CGC

370

GCG

410

780

CGT

385

GCA

394

779

CGA

394

GCT

385

779

CGG

410

GCC

370

780

AGA

418

TCT

360

778

AGG

434

TCC

345

779

 

 

СЕР

TCC

345

AGG

434

779

TCT

360

AGA

418

778

TCA

369

AGT

409

778

TCG

385

AGC

394

779

AGC

394

TCG

385

779

AGT

409

TCA

369

778

ФЕН

TTC

360

AAG

418

778

TTT

375

AAA

402

777

ТИР

TAC

369

ATG

409

778

TAT

384

ATA

393

777

 

НОН

TAA

393

ATT

384

777

TAG

409

ATC

369

778

TGA

409

ACT

369

778

ЦИС

TGC

385

ACG

394

779

TGT

400

ACA

378

778

ТРИ

TGG

425

ACC

370

779

 

ТРЕ

ACC

354

TGG

425

779

ACT

369

TGA

409

778

ACA

378

TGT

400

778

ACG

394

TGC

385

779

 

ИЛЕЙ

ATC

369

TAG

409

778

ATT

384

TAA

393

777

ATA

393

TAT

384

777

МЕТ

ATG

409

TAC

369

778

АСП-NH2

AAC

378

TTG

400

778

AAT

393

TTA

384

777

ЛИЗ

AAA

402

TTT

375

777

AAG

418

TTC

360

778

 

АЛА

GCC

370

CGG

410

780

GCT

385

CGA

394

779

GCA

394

CGT

385

779

GCG

410

CGC

370

780

 

ВАЛ

GTC

385

CAG

394

779

GTT

400

CAA

378

778

GTA

409

CAT

369

778

GTG

425

CAC

354

779

АСП

GAC

394

CTG

385

779

GAT

409

CTA

369

778

ГЛУ

GAA

418

CTT

360

778

GAG

434

CTC

345

779

 

ГЛИ

GGC

410

CCG

370

780

GGT

425

CCA

354

779

GGA

434

CCT

345

779

GGG

450

CCC

330

780

                       

Чем больше в геноме отношение (C+G)/(А+Т), тем устойчивее вид к внешним воздействиям и ограниченнее количество возможных вариантов.

Статистические данные (табл. 4) о нуклеотидном составе оснований (CºG, %) ДНК показывают, что чем сложнее вид, тем меньше диапазон изменения и значение верхней границы показателя (но  не менее 40% у позвоночных). Чем проще вид, тем он менее устойчив к внешним воздействиям.

 

Таблица 4

Вирусы

28-74

Бактерии

26-74

Простейшие

22-62

Водоросли

36-68

Грибы

36-54

Высшие растения

36-48

Беспозвоночные

34-44

Позвоночные

40-44

 

Если в пределах одного периода спирали необходимо обеспечить равномерность количества водородных связей между парами А=Т и CºG, то следует, чтобы в десятке нуклеотидов количество пар А=Т было равно 6, а CºG – 4, так как 6*2 = 4*3. Последнее равенство возможно, если А = Т = 3 и C = G = 2.

Распределения массы по структуре ДНК уравновешенное (табл. 5).

 

Таблица 5

А

Г

Ц

Т

134

150

110

125

 

Если подсчитать мольные массы кодонов, то окажется, что при 64 возможных комбинациях кодонов существует только 20 вариантов различных мольных масс (табл. 6), равно числу различных аминокислот.

 

Таблица 6

Количество кодонов

Мольная масса

Количество кодонов

Мольная масса

1

330

3

393

3

345

6

394

3

354

3

400

3

360

1

402

6

369

6

409

3

370

3

410

1

375

3

418

3

378

3

425

3

384

3

434

6

385

1

450

 

Свойство комплементарности выявляет еще одну особенность: число вариантов различных мольных масс системы «кодон+антикодон» равно четырем, а именно: 777, 778, 779, 780 (табл. 7). Суммарная масса Мк+Ма изменяется незначительно за счет того, что мольная масса двух комплементарных нуклеотидов А+Т=259 и C+G=260 практически одинакова.

 

Таблица 7

Количество

Суммарная масса Мк + Ма

8

777

23

778

23

779

10

780

 

Из анализа следует, что мольная масса по длине цепей распределена равномерно. Откуда важное свойство ДНК: при любом чередовании нуклеотидов в одной из спиралей ДНК общая структура молекулы будет уравновешенной. Наивысшая равномерность распределения масс и связей между спиралями ДНК наблюдается у позвоночных, для которых отношение .

Для обеспечения защищенности процесса передачи и хранения информации в ДНК используется принцип избыточности, как при размножении (передача информации), так и при хранении генома. Избыточность кода является одним из приемов повышения защищенности. Чем сложнее организм, тем большая избыточность кода генома.

Чем сложнее организм, тем сложнее способы размножения. Разделение особей на мужские и женские, внутривидовое разнообразие обеспечивают повышения устойчивости существования вида.

Хранение генетической информации высших организмов происходит в ядрах клеток. В каждой соматической клетке находится удвоенное количество наследственной информации - диплоидный набор хромосом. В процессе деления клетки одна “копия” остается в родительской клетке, а вторая передается дочерней и в последствии удваивается. В половых клетках набор хромосом гаплоидный и избыточность отсутствует, т. к. основная функция половых клеток не хранение, а перенос информации.

Таким образом, основные особенности кода ДНК, обеспечивающие устойчивость биосистем, можно свести к следующему набору:

·   комплементарность кодирования и информационная избыточность,

·   равномерность распределения масс и системы связей по ДНК.

 

Клетка как защищенный элемент биосистем.

 

Архитектура организма базируется на клетке. Клетка - отдельная система, которая в процессе жизнедеятельности осуществляет хранение и декодирование наследственной информации. Клеточный принцип построения сложных организмов – один из основных для обеспечения безопасности генома за счет значительной избыточности.

Многоклеточные организмы можно рассматривать как сложную ИС, состоящую из иерархии специализированных компонентов, которые выполняют функции по хранению всей наследственной информации, но обрабатывают и декодируют только определенную часть информации, связанную с функциями данных компонентов.

Клетка с точки зрения защищенности информационных процессов является компонентом, который осуществляет безопасное хранение и декодирование генетической информации. Причем функции хранения и обработки информации разнесены: системная информация хранится в ядре, структура которого ориентирована на защиту генетической информации, а скоростное декодирование информации выполняется вне ядра.

Организация процессов декодирования информации внутри клетки обладает повышенной защищенностью. Декодирование триплетного кода ведется по принципу сопоставления, известного из теории помехоустойчивого кодирования информации. Принцип - каждый кодон имеет только один антикодон, способный связаться с ним по всем водородным связям.

В процессе декодирования используются такие свойства ДНК как комплементарность и близость мольных масс нуклеотидов - пары нуклеотидов в коде могут иметь два вида мольных масс: (C+G) 260 и 259 (А+Т). Важно с точки зрения безопасности, что декодирование в клетке ведется не с самой ДНК, а с ее копии - iРНК. Свойство комплементарности кода ДНК можно рассматривать как средство повышения защищенности процесса декодирования и хранения информации за счет введения избыточности.

Особенности клетки как защищенной системы состоят в следующем: системная информация хранится в ядре; декодирование генома производится над дублем системной информации вне ядра специальными структурами, которые при декодировании используют принцип сопоставления комплементарного кода.

Важными механизмами защиты (МЗ) в биосистемах являются механизмы естественной иммунной системы (ЕИС), основу которых составля­ют процессы взаимодействия иммуноцитов и вырабатываемых ими цитокинов [6]. ЕИС состоит из специали­зированных органов с иерархической внутренней структурой, которые используют свойства иммуно­цитов, молекулярные особенности распознавания антигенов. Динамичная структура ЕИС учитывает специфику молекулярного и клеточного иммунного реагирования и иммунологической памяти в процессе иммунного ответа.

Иммунный ответ - физиологическая реак­ция, направленная на поддержание генетического постоянства внутренней среды организма. Поддержание гомеостаза обеспечивается функционированием ЕИС, которая защищает организм от продуктов чуждой генетической информации – антигенов (АГ). Роль ЕИС в защи­те организма от внешней агрессии, связанной с заражением инфекционными агентами, очевидна. Не менее важна иммунная за­щита от внутренней агрессии, вызванной мутантными и опухолевыми клетками (рис. 3) [6].

 

Рис. 3.

Функции иммунной системы.

 

Таким образом, отдельные клетки и биологические организмы в целом являются информационными системами, которые благодаря иерархической организации защиты, методам и принципам хранения, кодирования и декодирования информации являются информационно защищенными ИС.

 

Литература.

 

1.                  Нестерук Г. Ф., Осовецкий Л. Г., Харченко А. Ф. Информационная безопасность и интеллектуальные средства защиты информационных ресурсов. (Иммунология систем информационных технологий). – СПб.: Изд-во СПбГУЭФ, 2003.

2.                  Ивахненко А. Г. Принятие решений на основе самоорганизации. – М.: Сов. радио, 1976. 280 с.

3.                  Лобашев М. Е. Генетика. – Л.: Изд-во ленинградского университета, 1969.

4.                  Осовецкий Л. Г., Нестерук Г. Ф., Бормотов В. М. К вопросу иммунологии сложных информационных систем // Изв. вузов. Приборостроение. 2003. Т.46, № 7. С. 34 - 40.

5.                  Советский энциклопедический словарь / Гл. ред. А. М. Прохоров. - 3-е изд. – М.: Сов. энциклопедия, 1984.

6.                  Хаитов Р. М. Физиология иммунной системы. – М.: ВИНИТИ РАН, 2001.

7.                  Мелик-Гайназян И. В. Информационные процессы и реальность. М.: Наука. 1998. -192 с.

 

Поступила в редакцию 07.05.2008 г.

2006-2018 © Журнал научных публикаций аспирантов и докторантов.
Все материалы, размещенные на данном сайте, охраняются авторским правом. При использовании материалов сайта активная ссылка на первоисточник обязательна.